نیسکنز یکی از بهترین هافبک‌های دهه 1970 محسوب می‌شد. او در تیم آژاکس درخشید و در سال 1974 با بارسلونا قرارداد بست، تا سال 1979 برای بلوگرانا بازی کرد و سپس به تیم نیویورک کاسموس رفت.
او به درخواست هموطنش یعنی یوهان کرایف، اسطوره بزرگ بارسا، با آبی اناری‌ها قرارداد امضا کرد. نیسکنز به عنوان یک اسطوره از آژاکس وارد بارسلونا شد، تیمی که با آن سه جام اروپایی (1971، 1972 و 1973)، یک جام بین قاره‌ای و یک سوپرجام اروپا، و همچنین دو عنوان قهرمانی اردیویسه را به دست آورد.
دو جام با بارسلونا
یوهان نیسکنز به عنوان بازیکن بارسا دو عنوان به دست آورد و در مجموع 234 بازی انجام داد که در آن 56 گل برای بلوگرانا به ثمر رساند.
او عضو تیم بهترین بازیکنان جام جهانی 1974 قرار گرفت. این مرد هلندی سابقه مربیگری در بارسلونا را نیز داشت و در سال 2006 بخشی از کادر مربیگری فرانک رایکارد بود که قبلا در تیم ملی هلند با او کار کرده بود. نیسکنز در سال 2008 بارسلونا را ترک کرد.